Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFI27P40305 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFI27P40305 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFI27P40305 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFI27P40305 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFI27P40305 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFI27P40305 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFI27P40305 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFI27P40305 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFI27P40305 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFI27P40305 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFI27P40305 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFI27P40305 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFI27P40305 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFI27P40305 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFI27P40305 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFI27P40305 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFI27P40305 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFI27P40305 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFI27P40305 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFI27P40305 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFI27P40305 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFI27P40305 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFI27P40305 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFI27P40305 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFI27P40305 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFI27P40305 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFI27P40305 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFI27P40305 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFI27P40305 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFI27P40305 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFI27P40305 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFI27P40305 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFI27P40305 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFI27P40305 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFI27P40305 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1336.7 ms