Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPGP40121 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPGP40121 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPGP40121 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPGP40121 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPGP40121 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPGP40121 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPGP40121 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPGP40121 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPGP40121 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPGP40121 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPGP40121 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPGP40121 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPGP40121 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPGP40121 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPGP40121 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPGP40121 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPGP40121 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPGP40121 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPGP40121 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPGP40121 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPGP40121 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPGP40121 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPGP40121 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPGP40121 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPGP40121 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPGP40121 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPGP40121 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPGP40121 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPGP40121 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPGP40121 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPGP40121 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPGP40121 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPGP40121 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPGP40121 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPGP40121 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPGP40121 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPGP40121 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPGP40121 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPGP40121 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms