Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGCXP38435 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGCXP38435 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGCXP38435 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGCXP38435 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGCXP38435 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGCXP38435 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGCXP38435 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGCXP38435 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGCXP38435 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGCXP38435 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGCXP38435 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGCXP38435 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGCXP38435 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGCXP38435 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGCXP38435 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGCXP38435 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GGCXP38435 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGCXP38435 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGCXP38435 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGCXP38435 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGCXP38435 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGCXP38435 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGCXP38435 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGCXP38435 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GGCXP38435 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGCXP38435 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGCXP38435 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGCXP38435 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGCXP38435 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGCXP38435 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGCXP38435 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGCXP38435 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGCXP38435 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGCXP38435 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGCXP38435 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGCXP38435 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGCXP38435 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGCXP38435 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGCXP38435 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGCXP38435 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGCXP38435 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGCXP38435 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGCXP38435 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGCXP38435 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGCXP38435 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGCXP38435 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GGCXP38435 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGCXP38435 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGCXP38435 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GGCXP38435 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGCXP38435 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGCXP38435 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGCXP38435 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGCXP38435 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGCXP38435 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms