Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SREBF1P36956 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF1P36956 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF1P36956 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms