Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACVR1BP36896 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACVR1BP36896 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1BP36896 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms