Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDRP35968 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KDRP35968 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDRP35968 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDRP35968 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDRP35968 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
KDRP35968 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDRP35968 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KDRP35968 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDRP35968 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDRP35968 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDRP35968 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDRP35968 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDRP35968 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDRP35968 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDRP35968 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDRP35968 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDRP35968 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDRP35968 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDRP35968 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KDRP35968 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDRP35968 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
KDRP35968 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDRP35968 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDRP35968 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
KDRP35968 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDRP35968 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDRP35968 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDRP35968 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDRP35968 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDRP35968 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDRP35968 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDRP35968 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDRP35968 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
KDRP35968 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDRP35968 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDRP35968 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDRP35968 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDRP35968 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDRP35968 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDRP35968 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDRP35968 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDRP35968 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDRP35968 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDRP35968 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDRP35968 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDRP35968 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDRP35968 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
KDRP35968 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KDRP35968 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDRP35968 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDRP35968 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDRP35968 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDRP35968 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDRP35968 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDRP35968 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDRP35968 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDRP35968 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDRP35968 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDRP35968 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDRP35968 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDRP35968 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDRP35968 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDRP35968 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDRP35968 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDRP35968 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDRP35968 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDRP35968 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDRP35968 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDRP35968 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDRP35968 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDRP35968 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDRP35968 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDRP35968 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDRP35968 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDRP35968 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDRP35968 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDRP35968 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDRP35968 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms