Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCK1P35558 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCK1P35558 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCK1P35558 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCK1P35558 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCK1P35558 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCK1P35558 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCK1P35558 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCK1P35558 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCK1P35558 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCK1P35558 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCK1P35558 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCK1P35558 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCK1P35558 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCK1P35558 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCK1P35558 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCK1P35558 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCK1P35558 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCK1P35558 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCK1P35558 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCK1P35558 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCK1P35558 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCK1P35558 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCK1P35558 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCK1P35558 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCK1P35558 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCK1P35558 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCK1P35558 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCK1P35558 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCK1P35558 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCK1P35558 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCK1P35558 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCK1P35558 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCK1P35558 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCK1P35558 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCK1P35558 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCK1P35558 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCK1P35558 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCK1P35558 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCK1P35558 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCK1P35558 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCK1P35558 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCK1P35558 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCK1P35558 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCK1P35558 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCK1P35558 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCK1P35558 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCK1P35558 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCK1P35558 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCK1P35558 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCK1P35558 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCK1P35558 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCK1P35558 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCK1P35558 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCK1P35558 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCK1P35558 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCK1P35558 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCK1P35558 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCK1P35558 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCK1P35558 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCK1P35558 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCK1P35558 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCK1P35558 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCK1P35558 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCK1P35558 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCK1P35558 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCK1P35558 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCK1P35558 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCK1P35558 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCK1P35558 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCK1P35558 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCK1P35558 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCK1P35558 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCK1P35558 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCK1P35558 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCK1P35558 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCK1P35558 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCK1P35558 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCK1P35558 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCK1P35558 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCK1P35558 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCK1P35558 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCK1P35558 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms