Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PFN2P35080 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFN2P35080 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFN2P35080 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFN2P35080 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFN2P35080 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFN2P35080 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PFN2P35080 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN2P35080 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN2P35080 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN2P35080 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFN2P35080 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFN2P35080 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFN2P35080 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PFN2P35080 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFN2P35080 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFN2P35080 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFN2P35080 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFN2P35080 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFN2P35080 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms