Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC1P35052 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC1P35052 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC1P35052 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC1P35052 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC1P35052 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC1P35052 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC1P35052 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC1P35052 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC1P35052 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC1P35052 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC1P35052 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC1P35052 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC1P35052 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC1P35052 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC1P35052 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC1P35052 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC1P35052 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC1P35052 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC1P35052 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC1P35052 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC1P35052 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC1P35052 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC1P35052 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC1P35052 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC1P35052 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC1P35052 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC1P35052 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC1P35052 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC1P35052 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC1P35052 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC1P35052 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC1P35052 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC1P35052 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC1P35052 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC1P35052 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC1P35052 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC1P35052 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC1P35052 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC1P35052 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms