Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTF4P34130 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTF4P34130 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTF4P34130 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTF4P34130 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTF4P34130 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTF4P34130 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NTF4P34130 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTF4P34130 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTF4P34130 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF4P34130 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF4P34130 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF4P34130 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF4P34130 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF4P34130 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF4P34130 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF4P34130 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTF4P34130 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTF4P34130 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTF4P34130 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTF4P34130 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTF4P34130 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTF4P34130 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTF4P34130 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTF4P34130 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTF4P34130 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTF4P34130 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTF4P34130 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTF4P34130 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NTF4P34130 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTF4P34130 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTF4P34130 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTF4P34130 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTF4P34130 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTF4P34130 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF4P34130 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF4P34130 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTF4P34130 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTF4P34130 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTF4P34130 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTF4P34130 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF4P34130 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms