Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CIITAP33076 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CIITAP33076 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIITAP33076 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIITAP33076 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIITAP33076 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIITAP33076 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIITAP33076 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIITAP33076 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIITAP33076 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CIITAP33076 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIITAP33076 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIITAP33076 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIITAP33076 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CIITAP33076 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIITAP33076 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIITAP33076 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIITAP33076 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIITAP33076 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIITAP33076 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CIITAP33076 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIITAP33076 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIITAP33076 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIITAP33076 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIITAP33076 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CIITAP33076 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CIITAP33076 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIITAP33076 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIITAP33076 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIITAP33076 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIITAP33076 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIITAP33076 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIITAP33076 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIITAP33076 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIITAP33076 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIITAP33076 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIITAP33076 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIITAP33076 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIITAP33076 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIITAP33076 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CIITAP33076 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIITAP33076 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIITAP33076 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CIITAP33076 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIITAP33076 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CIITAP33076 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIITAP33076 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIITAP33076 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIITAP33076 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIITAP33076 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIITAP33076 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CIITAP33076 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIITAP33076 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIITAP33076 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIITAP33076 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CIITAP33076 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIITAP33076 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIITAP33076 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIITAP33076 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIITAP33076 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms