Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CLIP1P30622 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CLIP1P30622 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLIP1P30622 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms