Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC27P30260 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC27P30260 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC27P30260 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC27P30260 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC27P30260 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC27P30260 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC27P30260 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC27P30260 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC27P30260 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC27P30260 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC27P30260 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC27P30260 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC27P30260 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC27P30260 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC27P30260 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC27P30260 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC27P30260 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC27P30260 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC27P30260 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC27P30260 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC27P30260 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC27P30260 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC27P30260 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC27P30260 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC27P30260 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC27P30260 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC27P30260 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC27P30260 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC27P30260 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC27P30260 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC27P30260 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC27P30260 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC27P30260 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC27P30260 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC27P30260 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC27P30260 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC27P30260 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC27P30260 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC27P30260 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC27P30260 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC27P30260 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC27P30260 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC27P30260 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC27P30260 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDC27P30260 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC27P30260 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC27P30260 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC27P30260 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC27P30260 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC27P30260 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC27P30260 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC27P30260 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC27P30260 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC27P30260 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC27P30260 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC27P30260 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC27P30260 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC27P30260 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC27P30260 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC27P30260 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC27P30260 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC27P30260 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC27P30260 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC27P30260 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC27P30260 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC27P30260 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC27P30260 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC27P30260 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC27P30260 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC27P30260 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC27P30260 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC27P30260 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC27P30260 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC27P30260 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC27P30260 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC27P30260 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC27P30260 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC27P30260 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC27P30260 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC27P30260 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC27P30260 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC27P30260 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC27P30260 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC27P30260 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC27P30260 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC27P30260 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC27P30260 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC27P30260 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC27P30260 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC27P30260 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC27P30260 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms