Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK1P30085 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CMPK1P30085 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMPK1P30085 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms