Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD38P28907 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD38P28907 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD38P28907 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CD38P28907 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD38P28907 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD38P28907 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD38P28907 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD38P28907 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD38P28907 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD38P28907 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD38P28907 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD38P28907 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD38P28907 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD38P28907 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD38P28907 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD38P28907 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD38P28907 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD38P28907 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD38P28907 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD38P28907 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD38P28907 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD38P28907 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD38P28907 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD38P28907 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD38P28907 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD38P28907 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD38P28907 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD38P28907 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD38P28907 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD38P28907 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD38P28907 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD38P28907 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD38P28907 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD38P28907 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD38P28907 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD38P28907 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD38P28907 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD38P28907 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD38P28907 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD38P28907 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD38P28907 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD38P28907 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD38P28907 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD38P28907 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD38P28907 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD38P28907 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD38P28907 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD38P28907 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD38P28907 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD38P28907 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD38P28907 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD38P28907 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD38P28907 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD38P28907 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms