Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms