Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD27P26842 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD27P26842 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD27P26842 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD27P26842 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD27P26842 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD27P26842 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD27P26842 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD27P26842 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD27P26842 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD27P26842 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD27P26842 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD27P26842 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD27P26842 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD27P26842 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD27P26842 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD27P26842 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD27P26842 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD27P26842 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD27P26842 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD27P26842 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD27P26842 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD27P26842 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD27P26842 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD27P26842 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD27P26842 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD27P26842 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD27P26842 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD27P26842 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD27P26842 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD27P26842 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD27P26842 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD27P26842 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD27P26842 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD27P26842 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD27P26842 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD27P26842 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD27P26842 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD27P26842 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD27P26842 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD27P26842 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD27P26842 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD27P26842 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD27P26842 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD27P26842 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD27P26842 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD27P26842 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD27P26842 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD27P26842 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD27P26842 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD27P26842 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD27P26842 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD27P26842 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD27P26842 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD27P26842 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD27P26842 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD27P26842 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD27P26842 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD27P26842 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD27P26842 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD27P26842 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD27P26842 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD27P26842 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD27P26842 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD27P26842 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD27P26842 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD27P26842 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD27P26842 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD27P26842 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD27P26842 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD27P26842 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD27P26842 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms