Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VARSP26640 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VARSP26640 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VARSP26640 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VARSP26640 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VARSP26640 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VARSP26640 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VARSP26640 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VARSP26640 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VARSP26640 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VARSP26640 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VARSP26640 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VARSP26640 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VARSP26640 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VARSP26640 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VARSP26640 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VARSP26640 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VARSP26640 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VARSP26640 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VARSP26640 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VARSP26640 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VARSP26640 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VARSP26640 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VARSP26640 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VARSP26640 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VARSP26640 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VARSP26640 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VARSP26640 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VARSP26640 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VARSP26640 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VARSP26640 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VARSP26640 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VARSP26640 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VARSP26640 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VARSP26640 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VARSP26640 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VARSP26640 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VARSP26640 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VARSP26640 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VARSP26640 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VARSP26640 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VARSP26640 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VARSP26640 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VARSP26640 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VARSP26640 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VARSP26640 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VARSP26640 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VARSP26640 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VARSP26640 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VARSP26640 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VARSP26640 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VARSP26640 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VARSP26640 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VARSP26640 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VARSP26640 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VARSP26640 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VARSP26640 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VARSP26640 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VARSP26640 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VARSP26640 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VARSP26640 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VARSP26640 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VARSP26640 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VARSP26640 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VARSP26640 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms