Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTX3P26022 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTX3P26022 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTX3P26022 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTX3P26022 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTX3P26022 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTX3P26022 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTX3P26022 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTX3P26022 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTX3P26022 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTX3P26022 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTX3P26022 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTX3P26022 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTX3P26022 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTX3P26022 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTX3P26022 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTX3P26022 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTX3P26022 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTX3P26022 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTX3P26022 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTX3P26022 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTX3P26022 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTX3P26022 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTX3P26022 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTX3P26022 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTX3P26022 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTX3P26022 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTX3P26022 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTX3P26022 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTX3P26022 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTX3P26022 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTX3P26022 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTX3P26022 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTX3P26022 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTX3P26022 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTX3P26022 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTX3P26022 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms