Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRM1P23921 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRM1P23921 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRM1P23921 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRM1P23921 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRM1P23921 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRM1P23921 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRM1P23921 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRM1P23921 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRM1P23921 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRM1P23921 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRM1P23921 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRM1P23921 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRM1P23921 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRM1P23921 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRM1P23921 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRM1P23921 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRM1P23921 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRM1P23921 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRM1P23921 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRM1P23921 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRM1P23921 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRM1P23921 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRM1P23921 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRM1P23921 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRM1P23921 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRM1P23921 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRM1P23921 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRM1P23921 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRM1P23921 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRM1P23921 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRM1P23921 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRM1P23921 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRM1P23921 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RRM1P23921 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRM1P23921 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRM1P23921 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRM1P23921 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRM1P23921 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRM1P23921 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRM1P23921 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRM1P23921 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRM1P23921 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRM1P23921 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRM1P23921 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RRM1P23921 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRM1P23921 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRM1P23921 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRM1P23921 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRM1P23921 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRM1P23921 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRM1P23921 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRM1P23921 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRM1P23921 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRM1P23921 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRM1P23921 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRM1P23921 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRM1P23921 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRM1P23921 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRM1P23921 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRM1P23921 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRM1P23921 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRM1P23921 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRM1P23921 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RRM1P23921 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRM1P23921 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRM1P23921 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRM1P23921 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRM1P23921 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms