Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAX3P23760 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PAX3P23760 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAX3P23760 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAX3P23760 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX3P23760 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX3P23760 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAX3P23760 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAX3P23760 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAX3P23760 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAX3P23760 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAX3P23760 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX3P23760 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAX3P23760 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAX3P23760 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAX3P23760 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PAX3P23760 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAX3P23760 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAX3P23760 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAX3P23760 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAX3P23760 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAX3P23760 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAX3P23760 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX3P23760 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX3P23760 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX3P23760 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX3P23760 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX3P23760 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAX3P23760 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX3P23760 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX3P23760 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX3P23760 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAX3P23760 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAX3P23760 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX3P23760 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX3P23760 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX3P23760 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX3P23760 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX3P23760 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAX3P23760 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX3P23760 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PAX3P23760 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX3P23760 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX3P23760 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX3P23760 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAX3P23760 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms