Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3AP20336 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms