Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6GP18545 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6GP18545 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6GP18545 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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