Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2A2P16615 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP2A2P16615 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2A2P16615 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms