Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD44P16070 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CD44P16070 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD44P16070 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD44P16070 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD44P16070 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD44P16070 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD44P16070 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD44P16070 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD44P16070 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD44P16070 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD44P16070 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD44P16070 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD44P16070 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD44P16070 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CD44P16070 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD44P16070 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD44P16070 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD44P16070 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD44P16070 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD44P16070 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD44P16070 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD44P16070 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD44P16070 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD44P16070 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD44P16070 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CD44P16070 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD44P16070 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD44P16070 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD44P16070 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD44P16070 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD44P16070 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD44P16070 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD44P16070 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD44P16070 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD44P16070 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD44P16070 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD44P16070 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD44P16070 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD44P16070 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD44P16070 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD44P16070 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD44P16070 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD44P16070 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD44P16070 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD44P16070 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD44P16070 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD44P16070 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CD44P16070 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD44P16070 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD44P16070 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD44P16070 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD44P16070 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD44P16070 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD44P16070 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD44P16070 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD44P16070 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD44P16070 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD44P16070 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD44P16070 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD44P16070 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD44P16070 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD44P16070 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD44P16070 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms