Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD46P15529 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD46P15529 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD46P15529 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD46P15529 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD46P15529 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD46P15529 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD46P15529 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD46P15529 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD46P15529 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD46P15529 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD46P15529 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD46P15529 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD46P15529 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD46P15529 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD46P15529 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD46P15529 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD46P15529 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD46P15529 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD46P15529 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD46P15529 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD46P15529 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD46P15529 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD46P15529 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD46P15529 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD46P15529 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD46P15529 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD46P15529 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD46P15529 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD46P15529 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD46P15529 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD46P15529 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD46P15529 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD46P15529 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD46P15529 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD46P15529 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD46P15529 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD46P15529 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD46P15529 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD46P15529 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD46P15529 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD46P15529 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD46P15529 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD46P15529 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD46P15529 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD46P15529 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD46P15529 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD46P15529 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD46P15529 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD46P15529 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD46P15529 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD46P15529 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD46P15529 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD46P15529 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD46P15529 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD46P15529 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD46P15529 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD46P15529 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD46P15529 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD46P15529 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD46P15529 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms