Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA3P15088 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA3P15088 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA3P15088 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA3P15088 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPA3P15088 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA3P15088 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA3P15088 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA3P15088 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA3P15088 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPA3P15088 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPA3P15088 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPA3P15088 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA3P15088 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA3P15088 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA3P15088 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA3P15088 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA3P15088 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA3P15088 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA3P15088 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA3P15088 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA3P15088 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA3P15088 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPA3P15088 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA3P15088 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA3P15088 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA3P15088 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA3P15088 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA3P15088 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA3P15088 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA3P15088 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA3P15088 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA3P15088 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA3P15088 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA3P15088 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA3P15088 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms