Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB2P14652 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB2P14652 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB2P14652 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms