Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFAP13804 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFAP13804 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFAP13804 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFAP13804 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFAP13804 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFAP13804 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFAP13804 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFAP13804 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFAP13804 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFAP13804 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFAP13804 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFAP13804 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFAP13804 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFAP13804 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFAP13804 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFAP13804 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFAP13804 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFAP13804 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFAP13804 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFAP13804 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFAP13804 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFAP13804 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFAP13804 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFAP13804 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFAP13804 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFAP13804 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFAP13804 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFAP13804 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFAP13804 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETFAP13804 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETFAP13804 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETFAP13804 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETFAP13804 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ETFAP13804 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFAP13804 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFAP13804 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFAP13804 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFAP13804 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFAP13804 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFAP13804 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFAP13804 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFAP13804 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFAP13804 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFAP13804 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFAP13804 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFAP13804 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFAP13804 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFAP13804 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFAP13804 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFAP13804 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETFAP13804 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETFAP13804 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFAP13804 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFAP13804 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFAP13804 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFAP13804 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFAP13804 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFAP13804 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFAP13804 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFAP13804 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFAP13804 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFAP13804 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFAP13804 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFAP13804 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFAP13804 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFAP13804 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFAP13804 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFAP13804 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFAP13804 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFAP13804 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFAP13804 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFAP13804 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFAP13804 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFAP13804 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms