Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK4P11802 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK4P11802 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK4P11802 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK4P11802 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK4P11802 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK4P11802 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK4P11802 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK4P11802 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK4P11802 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK4P11802 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK4P11802 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK4P11802 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK4P11802 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK4P11802 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK4P11802 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK4P11802 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK4P11802 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK4P11802 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK4P11802 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK4P11802 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK4P11802 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK4P11802 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK4P11802 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK4P11802 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK4P11802 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK4P11802 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK4P11802 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK4P11802 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK4P11802 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK4P11802 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK4P11802 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK4P11802 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK4P11802 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK4P11802 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK4P11802 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK4P11802 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK4P11802 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK4P11802 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK4P11802 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK4P11802 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK4P11802 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK4P11802 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK4P11802 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK4P11802 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK4P11802 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK4P11802 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK4P11802 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK4P11802 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK4P11802 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK4P11802 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK4P11802 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK4P11802 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK4P11802 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms