Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BCRP11274 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCRP11274 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCRP11274 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCRP11274 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BCRP11274 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCRP11274 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCRP11274 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCRP11274 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCRP11274 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCRP11274 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCRP11274 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCRP11274 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCRP11274 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCRP11274 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCRP11274 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCRP11274 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCRP11274 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCRP11274 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BCRP11274 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCRP11274 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCRP11274 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCRP11274 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCRP11274 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCRP11274 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCRP11274 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCRP11274 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCRP11274 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCRP11274 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BCRP11274 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BCRP11274 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCRP11274 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCRP11274 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCRP11274 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCRP11274 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCRP11274 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCRP11274 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BCRP11274 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BCRP11274 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCRP11274 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCRP11274 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCRP11274 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCRP11274 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCRP11274 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCRP11274 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCRP11274 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCRP11274 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCRP11274 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCRP11274 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCRP11274 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCRP11274 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCRP11274 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BCRP11274 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCRP11274 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCRP11274 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCRP11274 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCRP11274 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCRP11274 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCRP11274 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCRP11274 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCRP11274 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCRP11274 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCRP11274 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCRP11274 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCRP11274 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCRP11274 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCRP11274 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCRP11274 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCRP11274 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCRP11274 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCRP11274 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCRP11274 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCRP11274 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCRP11274 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCRP11274 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCRP11274 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCRP11274 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCRP11274 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCRP11274 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCRP11274 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCRP11274 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCRP11274 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCRP11274 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCRP11274 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCRP11274 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCRP11274 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms