Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VSIG8P0DPA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG8P0DPA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG8P0DPA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms