Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSIG10L2P0DP72 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSIG10L2P0DP72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG10L2P0DP72 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG10L2P0DP72 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms