Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OPN1MW3P0DN78 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
OPN1MW3P0DN78 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
OPN1MW3P0DN78 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms