Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms