Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM6P0DI80 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM6P0DI80 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM6P0DI80 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms