Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP17L7P0C7H9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L7P0C7H9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L7P0C7H9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms