Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40ALP0C0E4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40ALP0C0E4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40ALP0C0E4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms