Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFICP08651 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFICP08651 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFICP08651 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFICP08651 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFICP08651 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFICP08651 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFICP08651 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFICP08651 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFICP08651 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFICP08651 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFICP08651 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFICP08651 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFICP08651 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFICP08651 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFICP08651 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFICP08651 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFICP08651 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFICP08651 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFICP08651 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFICP08651 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFICP08651 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFICP08651 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFICP08651 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFICP08651 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFICP08651 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFICP08651 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFICP08651 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFICP08651 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFICP08651 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFICP08651 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NFICP08651 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFICP08651 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFICP08651 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFICP08651 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFICP08651 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFICP08651 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFICP08651 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NFICP08651 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFICP08651 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFICP08651 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFICP08651 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFICP08651 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFICP08651 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFICP08651 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFICP08651 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFICP08651 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFICP08651 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFICP08651 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFICP08651 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFICP08651 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFICP08651 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFICP08651 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFICP08651 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFICP08651 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFICP08651 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFICP08651 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFICP08651 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFICP08651 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFICP08651 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFICP08651 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFICP08651 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFICP08651 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFICP08651 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFICP08651 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFICP08651 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFICP08651 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NFICP08651 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFICP08651 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFICP08651 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFICP08651 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms