Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG5P05408 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG5P05408 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG5P05408 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG5P05408 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG5P05408 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG5P05408 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG5P05408 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG5P05408 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG5P05408 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG5P05408 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG5P05408 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG5P05408 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG5P05408 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG5P05408 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG5P05408 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG5P05408 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG5P05408 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG5P05408 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG5P05408 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG5P05408 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG5P05408 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG5P05408 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG5P05408 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG5P05408 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG5P05408 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG5P05408 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG5P05408 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG5P05408 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG5P05408 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG5P05408 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG5P05408 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG5P05408 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG5P05408 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG5P05408 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG5P05408 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG5P05408 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG5P05408 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG5P05408 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCG5P05408 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG5P05408 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG5P05408 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCG5P05408 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCG5P05408 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCG5P05408 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SCG5P05408 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG5P05408 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG5P05408 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms