Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A1P05023 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1P05023 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1P05023 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1P05023 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms