Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHBGP04278 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHBGP04278 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHBGP04278 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHBGP04278 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHBGP04278 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHBGP04278 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHBGP04278 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHBGP04278 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHBGP04278 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHBGP04278 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHBGP04278 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHBGP04278 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHBGP04278 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHBGP04278 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHBGP04278 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHBGP04278 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHBGP04278 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHBGP04278 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHBGP04278 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHBGP04278 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHBGP04278 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHBGP04278 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHBGP04278 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHBGP04278 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHBGP04278 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHBGP04278 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHBGP04278 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHBGP04278 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHBGP04278 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHBGP04278 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHBGP04278 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHBGP04278 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHBGP04278 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHBGP04278 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHBGP04278 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHBGP04278 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHBGP04278 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHBGP04278 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHBGP04278 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHBGP04278 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHBGP04278 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHBGP04278 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHBGP04278 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHBGP04278 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHBGP04278 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHBGP04278 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHBGP04278 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHBGP04278 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHBGP04278 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHBGP04278 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHBGP04278 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHBGP04278 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHBGP04278 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHBGP04278 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHBGP04278 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHBGP04278 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHBGP04278 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHBGP04278 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHBGP04278 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms