Protein–RNA interactions for Protein: P02747

C1QC, Complement C1q subcomponent subunit C, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QCP02747 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QCP02747 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QCP02747 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QCP02747 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QCP02747 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QCP02747 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QCP02747 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QCP02747 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QCP02747 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QCP02747 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QCP02747 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QCP02747 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QCP02747 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QCP02747 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QCP02747 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QCP02747 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QCP02747 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QCP02747 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QCP02747 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QCP02747 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QCP02747 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QCP02747 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QCP02747 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QCP02747 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QCP02747 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QCP02747 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QCP02747 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QCP02747 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QCP02747 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QCP02747 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QCP02747 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QCP02747 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QCP02747 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QCP02747 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QCP02747 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QCP02747 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QCP02747 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QCP02747 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms