Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HLA-DRAP01903 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-DRAP01903 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DRAP01903 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms