Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CST3P01034 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CST3P01034 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CST3P01034 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CST3P01034 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CST3P01034 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CST3P01034 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CST3P01034 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CST3P01034 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CST3P01034 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CST3P01034 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CST3P01034 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CST3P01034 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CST3P01034 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CST3P01034 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CST3P01034 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CST3P01034 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CST3P01034 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CST3P01034 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CST3P01034 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CST3P01034 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CST3P01034 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CST3P01034 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CST3P01034 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CST3P01034 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CST3P01034 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CST3P01034 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CST3P01034 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CST3P01034 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CST3P01034 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CST3P01034 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CST3P01034 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CST3P01034 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CST3P01034 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CST3P01034 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CST3P01034 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CST3P01034 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CST3P01034 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CST3P01034 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CST3P01034 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CST3P01034 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CST3P01034 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CST3P01034 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CST3P01034 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST3P01034 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST3P01034 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST3P01034 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST3P01034 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST3P01034 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST3P01034 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CST3P01034 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CST3P01034 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CST3P01034 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CST3P01034 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CST3P01034 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CST3P01034 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST3P01034 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST3P01034 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST3P01034 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST3P01034 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST3P01034 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST3P01034 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CST3P01034 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CST3P01034 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CST3P01034 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms