Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBB3O95704 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBB3O95704 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBB3O95704 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBB3O95704 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBB3O95704 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBB3O95704 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBB3O95704 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBB3O95704 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBB3O95704 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBB3O95704 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBB3O95704 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBB3O95704 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBB3O95704 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBB3O95704 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBB3O95704 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APBB3O95704 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBB3O95704 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBB3O95704 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBB3O95704 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBB3O95704 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBB3O95704 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBB3O95704 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBB3O95704 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBB3O95704 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBB3O95704 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBB3O95704 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBB3O95704 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBB3O95704 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBB3O95704 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBB3O95704 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBB3O95704 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBB3O95704 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBB3O95704 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBB3O95704 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBB3O95704 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBB3O95704 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBB3O95704 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBB3O95704 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBB3O95704 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBB3O95704 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBB3O95704 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBB3O95704 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBB3O95704 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBB3O95704 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBB3O95704 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBB3O95704 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APBB3O95704 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBB3O95704 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBB3O95704 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBB3O95704 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBB3O95704 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APBB3O95704 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBB3O95704 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBB3O95704 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBB3O95704 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBB3O95704 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBB3O95704 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBB3O95704 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBB3O95704 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBB3O95704 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBB3O95704 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBB3O95704 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBB3O95704 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBB3O95704 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBB3O95704 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBB3O95704 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBB3O95704 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBB3O95704 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBB3O95704 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBB3O95704 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBB3O95704 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms