Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD1O95696 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD1O95696 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD1O95696 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD1O95696 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD1O95696 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD1O95696 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD1O95696 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD1O95696 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD1O95696 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD1O95696 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD1O95696 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD1O95696 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD1O95696 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD1O95696 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD1O95696 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD1O95696 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD1O95696 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD1O95696 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD1O95696 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD1O95696 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD1O95696 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD1O95696 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD1O95696 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD1O95696 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD1O95696 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD1O95696 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD1O95696 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD1O95696 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD1O95696 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD1O95696 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD1O95696 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD1O95696 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD1O95696 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD1O95696 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD1O95696 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD1O95696 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD1O95696 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD1O95696 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD1O95696 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD1O95696 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD1O95696 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD1O95696 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD1O95696 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD1O95696 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD1O95696 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD1O95696 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD1O95696 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD1O95696 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD1O95696 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD1O95696 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD1O95696 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD1O95696 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD1O95696 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRD1O95696 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD1O95696 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD1O95696 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD1O95696 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD1O95696 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD1O95696 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD1O95696 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD1O95696 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD1O95696 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BRD1O95696 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD1O95696 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD1O95696 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD1O95696 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD1O95696 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD1O95696 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD1O95696 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD1O95696 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD1O95696 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD1O95696 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD1O95696 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD1O95696 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD1O95696 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD1O95696 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD1O95696 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD1O95696 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD1O95696 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms