Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF1O95521 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF1O95521 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms