Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC24BO95487 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SEC24BO95487 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC24BO95487 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms