Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM13AO94988 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM13AO94988 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms